Marseille Innovation se distingue en tant que plus grande structure d'accompagnement de startups à Marseille, opérant sur 4 campus. Elle offre une guidance complète et des financements aux entrepreneurs innovants, de la genèse à l'expansion internationale, en utilisant une méthodologie distinctive.
L'institution soutient actuellement 150 startups dans divers domaines, dont l'innovation numérique, la santé, les industries futures, le tourisme et l'environnement. De plus, Marseille Innovation gère un fonds d'innovation pour stimuler les startups en phase précoce, une initiative d'incubation ciblant le tourisme, ainsi que des programmes internationaux en Afrique et en Amérique du Nord. Des succès notables parmi les membres de Marseille Innovation incluent Provepharm, Enovacom, Seres Technologies, Skeepers, Traxens et Mailinblack. Ainsi, portée par ces accomplissements, Marseille Innovation se positionne comme un acteur clé dans l'innovation régionale et l'économie.
L'institution bénéficie de la reconnaissance de l'UE en tant que Centre Européen d'Entreprises et d'Innovation (CEEI). Elle est soutenue par trois partenaires publics historiques : la Métropole Aix Marseille Provence, la Région Provence-Alpes-Côte d'Azur et la Ville de Marseille. Sous la direction de la Directrice Générale Laurence Olivier, Marseille Innovation vise à habiliter une nouvelle génération d'entrepreneurs, à favoriser l'entrepreneuriat en dotant les fondateurs de compétences essentielles, et à contribuer à l'attrait économique et à la promotion de la région. En tant qu'association, la gouvernance de Marseille Innovation repose sur un conseil privé composé de professionnels de l'industrie, de financiers, d'anciens élèves et de représentants de l'écosystème.